Достаточно установить пакет под одним регистрационным номером (головного вуза). А вот при представлении РУП от имени филиалов, имеющих свои регистрационные номера, необходимо учитывать особенность именования файлов: имя файла РУП должно оканчиваться правильным регистрационным номером аттестуемого филиала.